联盟舰队和神秘舰队在击退外星生物后，开始全力修复战舰和恢复战斗力。在宇宙的黑暗背景下，战舰上的灯光如同繁星般闪烁，维修人员在受损的舰体和系统间忙碌穿梭，焊接的火花和能量工具的光芒交织在一起。

科学家们聚集在临时搭建的研究舱室中，围绕着古老文明的知识和外星生物带来的信息展开深入探讨。那些记录着古老文明仪式和神秘力量相关的数据在显示屏上滚动，他们试图从中找到更多线索。

“从目前的信息来看，这种神秘力量似乎具有某种智能，它不是单纯的能量或物理现象。”一位科学家皱着眉头说道，“它可能会主动寻找文明的弱点并进行攻击。”

“那我们得先确定它的攻击模式和传播途径。”另一位科学家回应道。

在研究过程中，他们发现古老文明在应对这种神秘力量时，曾使用过一种特殊的能量矩阵。这种能量矩阵由多种不同频率和性质的能量交织而成，能够在一定程度上抵御神秘力量的侵蚀。

“我们可以尝试在战舰上构建这种能量矩阵，作为一种防御手段。”科学家向指挥官建议。

两支舰队开始按照科学家的方案行动。技术人员在战舰的关键部位安装特殊的能量发生器和调制器，按照古老文明的记载，小心翼翼地构建能量矩阵。这是一项复杂而精细的工作，任何一点小的失误都可能导致能量失衡，对战舰造成严重破坏。

然而，在他们忙于构建防御的同时，新的危机正在悄然降临。在舰队的探测范围边缘，一些不明物体正在快速接近。这些物体没有明显的能量信号，但却能巧妙地避开舰队的探测波，就像宇宙中的幽灵。

“加强探测，我感觉有不好的事情要发生。”舰队指挥官眉头紧锁。

当不明物体靠近到一定距离时，舰队的警报系统终于发现了它们。这些不明物体是一种新型的机械生物，它们的身体由黑色的金属和闪烁着诡异光芒的晶体组成。机械生物的外形像巨大的蝎子，有着锋利的金属爪子和可以发射能量脉冲的尾巴。

“准备战斗！”指挥官下令。战舰迅速进入战斗状态，能量武器充能，护盾强度提升。

新型机械生物发动了攻击，它们以极快的速度冲向舰队。在接近过程中，它们的身体表面释放出一种黑色的能量烟雾，这种烟雾能够干扰战舰的探测系统和能量武器的瞄准。

“开启光学和红外探测，手动瞄准射击！”战士们迅速调整作战方式。

能量武器在手动瞄准下向新型机械生物开火，但这些生物的金属外壳极为坚硬，能量光束只能在上面留下浅浅的痕迹。它们冲进舰队中，用锋利的爪子攻击战舰的护盾和舰体。一些战舰的护盾在机械生物的攻击下出现了波动，甚至有小型护卫舰被机械生物的爪子撕开了护盾，舰体受到了损伤。

“集中火力攻击它们的关节部位，那里可能是弱点！”经验丰富的战士喊道。舰队调整攻击方向，朝着机械生物的关节处射击。在持续的攻击下，部分机械生物的关节被破坏，行动变得迟缓起来。

但机械生物并没有就此退缩，它们开始改变战术。一些机械生物聚集在一起，形成了一个巨大的球体，然后朝着一艘大型战舰滚去。这个球体在滚动过程中不断吸收周围的能量，包括战舰护盾的能量。

“发射导弹，阻止它们！”指挥官下令。导弹朝着机械生物组成的球体飞去，在撞击的瞬间，发生了剧烈的爆炸。然而，球体并没有被炸毁，只是被炸散，机械生物们在爆炸的冲击下短暂分开后，又迅速重新组合，继续朝着战舰冲来。

与此同时，神秘舰队的灵能使用者们感觉到了一种奇怪的能量干扰。这种干扰似乎来自新型机械生物，但又与他们之前遇到的能量形式不同。

“这些机械生物身上有神秘力量的气息，它们可能是被神秘力量控制的。”灵能指挥官说道。

在战斗的关键时刻，战舰上构建的能量矩阵终于完成了部分。当能量矩阵启动时，周围的战舰受到了保护，新型机械生物在接近这些战舰时，行动明显受到了阻碍。它们的黑色能量烟雾在遇到能量矩阵的防护范围时，开始逐渐消散。

“这能量矩阵有效，继续完善它！”指挥官看到希望，喊道。

然而，神秘力量似乎察觉到了能量矩阵对它控制的机械生物的影响。它开始加大对机械生物的能量注入，机械生物的身体开始发出更强烈的光芒，它们的攻击也变得更加疯狂。

一些机械生物不顾自身安危，朝着能量矩阵所在的战舰发动自杀式攻击。它们用自己的身体撞击战舰，试图破坏能量矩阵。在撞击过程中，机械生物的身体发生爆炸，产生的能量冲击对战舰的护盾和舰体造成了严重的损害。

联盟舰队和神秘舰队陷入了苦战，他们既要应对新型机械生物的疯狂攻击，又要保护刚刚构建的能量矩阵。而这一切的背后，是神秘力量在操控着局势。他们能否找到彻底击败新型机械生物的方法，破解神秘力量的阴谋，以及在这场危机中保护好古老文明的知识和舰队自身，一切都还是未知数，宇宙仿佛是一个残酷的战场，不断地向他们抛出新的挑战，而两支舰队正站在生死边缘，与未知的敌人展开殊死搏斗，未来的命运在这场激烈的战斗中摇摆不定。